Penelitian ini dilatar belakangi oleh pentingnya manajemen kesiswaan secara holistik di lembaga pendidikan Islam berbasis pesantren, di mana mayoritas siswa mengikuti kegiatan ekstrakurikuler karena kesulitan operasional, prasarana, dan sarana. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menggambarkan bagaimana manajemen kesiswaan dilaksanakan, memahami tingkat kepuasan siswa, dan menganalisis secara empiris pengaruh manajemen kesiswaan terhadap kepuasan siswa di Madrasah Aliyah Mutiara Qur’an Boarding School Bengkalis. Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan metode regresi linier. Populasi dalam penelitian ini terdiri dari seluruh 31 siswa di Madrasah Aliyah Mutiara Qur'an Boarding School Bengkalis. Teknik pengambilan sampel yang digunakan disebut Exhaustive Sampling (sampling jenuh/sensus), di mana seluruh 31 anggota populasi digunakan sebagai sampel penelitian. Pengumpulan data dilakukan melalui observasi, dokumentasi, dan kuesioner (angket tertutup dengan skala Likert). Analisis data dilakukan menggunakan perangkat lunak SPSS 25.0 untuk Windows. Hasil dari studi deskriptif menunjukkan bahwa mayoritas responden memberikan "Setuju" (ditemukan dalam kategori "baik" atau "sangat baik") terkait dengan variabel Manajemen Kesiswaan (Variabel X) dan Kepuasan Siswa (Variabel Y). Sebanyak 259 jawaban Setuju dan 133 jawaban Sangat Setuju membentuk rekapitulasi keseluruhan angket kesiswaan. Sebaliknya, 260 jawaban Setuju dan 118 jawaban Sangat Setuju terdapat pada angket kepuasan siswa. Berdasarkan hipotesis, penelitian ini meneliti signifikansi pengaruh menggunakan Uji T, Uji F, dan Koefisien Determinasi (R2) untuk menentukan apakah Ha (adanya pengaruh signifikan antara manajemen kesiswaan dan kepuasan siswa) diterima atau Ho ditolak. Secara umum, manajemen siswa yang profesional, responsif, dan kuat secara struktural merupakan faktor strategis dalam meningkatkan kepercayaan dan keyakinan diri siswa dalam mewujudkan potensi non-akademik mereka di lingkungan pesantren.